8月15日戰敗日將近，參拜靖國神社再次在日本成為敏感話題。13日，共同社接連發表多篇文章，曝光日本海上自衛隊多年來集體參拜靖國神社，并質疑這一行為違反日本憲法規定的“政教分離”原則。

據共同社稱，自衛隊集體參拜的消息來自靖國神社社刊《靖國》(月刊)。該刊最近一期刊文稱，5月20日，海上自衛隊的訓練艦隊司令和初級指揮官等共119人在出海遠洋訓練前，“身穿制服”到靖國神社進行集體參拜。日本防衛省就此稱，“自衛隊員們在休息時間，為了學習歷史參觀‘游就館’(靖國神社展館)”，并由個人交了祭祀費用。報道稱，根據《靖國》的報道，至少在2000年以后，每年都有自衛隊員在出發訓練前集體參拜靖國神社。

此外，《靖國》還稱，1999年航空自衛隊干部學校的二佐(相當于中校)教官等共24人進行了集體參拜，防衛省官員幾乎每年都有人參加春季和秋季的例行大祭。多年來，自衛隊員常常幫助打掃神社院落；此外，作為防衛大學(位于神奈川縣橫須賀市)學生的自主性活動之一，從學校至靖國神社的夜間行進也持續了多年。共同社稱，《靖國》2012年2月刊還公布了一封曾任自衛隊駐伊拉克隊員、眾議員佐藤正久的一封信，他稱，為了密切靖國神社和自衛隊的聯系，應開展將在海外執行任務期間犧牲的自衛隊員“合祀”到靖國神社的全民討論。

二戰時期，神道教成為日本軍國主義的精神支柱，推動日本走上侵略道路。因此，戰后日本制定的和平憲法禁止國家賦予宗教團體特權，禁止國家及其機構為宗教組織或宗教活動提供公共資金。共同社13日稱，在“政教分離”條款的具體判斷中，日本最高法院主要從兩點出發：國家及其機關的行為目的是否帶有宗教意義、該行為是否對宗教產生助長或壓制作用。共同社編輯委員石山永一郎認為，防衛省稱“自衛隊員在休息期間自行參拜”，不違反憲法第20條第2款的“強制參加宗教活動”，但是參拜是否是公務中，是否屬于對靖國神社的“援助、主張與促進”等仍然非常微妙。雖然不是集體參拜，但是作為“自主性行動”，自衛隊員打掃靖國神社，從防衛大學到靖國神社的夜間行進等，都表明靖國神社與防衛省關系密切。在安倍解禁集體自衛權使自衛隊任務活動危險性進一步增加的情況下，兩者的“密切關系”今后將引起不少議論。

神戶學院大學憲法學副教授福島敏明表示，以自衛隊員的身份、身著制服前去參拜，就可以說是以公務參拜。這與其說是個別自衛隊員的問題，更有必要思考常年參拜靖國神社的自衛隊是否存在組織上的問題。集體參拜相向于民眾發出“靖國神社被特別看待”、“靖國神社和自衛隊存在特別的關系”等信息。從靖國神社在社刊上刊登該報道來看，這也符合最高法院作為違憲判斷的基準，有違反憲法的嫌疑。